LINUM

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Bienvenue sur le site web du LINUM, le Laboratoire d’Imagerie Numérique, Neurophotonique et Microscopie (LINUM).

Présentation du LINUM

Ce laboratoire est situé au département d’informatique de l’université du Québec à Montréal (UQÀM). Il est dirigé par Joël Lefebvre, un professeur au département d’informatique depuis janvier 2020. La recherche effectuée par ce laboratoire porte sur le développement de techniques de vision par ordinateur et d’algorithmes d’analyse d’image pour la microscopie et la neurophotonique. Le but du LINUM est de mieux comprendre l’organisation du cerveau en exploitant des modalités d’imagerie optique et des méthodes de pointe en analyse de données.

Les principaux projets de recherche de ce laboratoire portent sur la neurophotonique et l’analyse d’images biomédicales. En particulier, nous utilisons plusieurs modalités d’imagerie (histologie sérielle, microscopie par cohérence optique, microscopie 2-photons, IRM de diffusion, etc.) pour imager des cerveaux entiers de souris ex vivo. Le but est de mieux comprendre l’organisation de la matière blanche et de ses croisements afin d’améliorer les performances des algorithmes de tractographie utilisés en clinique avec les données IRM de diffusion. De plus, ces projets de recherche visent à combiner microscopie et intelligence artificielle afin d’assister les utilisateurs des microscopes et de faciliter la découverte d’information pour la recherche biomédicale et le diagnostic. Cet axe de recherche se nomme la microscopie augmentée.

Membres du laboratoire

Direction

Biographie : Joël Lefebvre est professeur d’imagerie numérique et de vision par ordinateur au département d’informatique de l’UQÀM, chercheur associé à l’Institut de Cardiologie de Montréal et directeur du Laboratoire d’imagerie numérique, de neurophotonique et de microscopie (LINUM). Il a une formation interdisciplinaire en génie physique et biomédical, avec une spécialisation en traitement d’images et en vision par ordinateur appliquée à la neurophotonique. Il a obtenu une maîtrise en sciences appliquées (génie biomédical) et un doctorat en génie biomédical de l’École Polytechnique de Montréal sous la direction de F. Lesage. Il a été chercheur postdoctoral au Big Data Institute de l’Université d’Oxford sous la direction de J. Rittscher. Ses principales activités de recherche portent sur l’histologie sérielle par tomographie par cohérence optique de cerveaux entiers de souris, l’imagerie optique de la myéline et l’apprentissage profond appliqué à l’analyse de données de microscopie 3D.

3e cycle

  • (É2023 – En cours) Charles Poirier. Doctorat en informatique (Boursier BESC-D du CRSNG, Université Sherbrooke, cosupervision avec Maxime Descoteaux) (GitHub)
  • (A2022 – En cours) Frans Irgolitsch. Doctorat en génie biomédical (Polytechnique Montréal, cosupervision avec Frédéric Lesage) (LinkedIn)

2e cycle

  • (E2024 – En cours) Étienne Comtois. Maîtrise en informatique, concentration IA (UQAM) (LinkedIn)
  • (H2024 – En cours) Guillaume Carignan. Maîtrise en informatique, concentration IA (UQAM) (LinkedIn)
  • (H2024 – En cours) François Huppé-Marcoux. Maîtrise en informatique, concentration IA (UQAM) (LinkedIn)

1er cycle

  • (H2024) Sabrina Pelletier. Stage d’initiation à la recherche (Programme BIGL-COOP)
  • (H2024) Alex Neault. INF6200 – Initiation à la recherche (LinkedIn)

Personnels de recherche

  • (A2023 – En cours) Mohamad Hawchar. Agent de soutien à la recherche (LinkedIn)
  • (2023) François Huppé-Marcoux. Agent de soutien à la recherche (LinkedIn)

Alumni

  • (H2022 – É2023) Mohamad Hawchar. Maîtrise en informatique, concentration IA (UQAM). (LinkedIn, Résumé du projet)
  • (H2021 – A2023) Philippe Lemieux. Maîtrise en informatique, concentration IA (UQAM). (LinkedIn)
  • (A2020 – E2023) Maxime Faubert-Laurin. Maîtrise en informatique (UQAM, cosupervision avec Marie-Jean Meurs). (LinkedIn)
  • (Été 2023) Alexandre Fortin. Stage d’initiation à la recherche (UQAM). (LinkedIn)
  • (Été 2023) Alexandre Howison. Stage d’initiation à la recherche (UQAM). (LinkedIn)
  • (Été 2023) Alexia Pragassam. Stage de recherche. (Polytechnique Montréal / Polytech Paris-Saclay, cosupervision avec Frédéric Lesage). (LinkedIn)
  • (Été 2023) Étienne Comtois. Cours INF6200 : Initiation à la recherche & stage de recherche BRPC. (UQAM, cosupervision avec Marie-Jean Meurs). (LinkedIn, Résumé du projet)
  • (Été 2023) Julien Reynaud. Stage de recherche. (École ENSEEIHT à Toulouse, France)
  • (Été 2022) Anna Pasquier. Stage pour un projet de fin d’étude (IMT Nord Europe) (LinkedIn)
  • (Été 2022) Mona Chouchane. Stage final au DUT Informatique (Université Paris Saclay) (LinkedIn)
  • (Hiver/Été 2022) Benoît Dubreuil. Cours INF6200 : Initiation à la recherche, Stage III du programme coop en informatique (UQÀM). (LinkedIn)
  • (Été 2022) Mahdi Abou-Hamdan. Stage de recherche (U.Lorraine/Bordeaux/UQÀM). Cosupervision avec Laurent Petit.
  • (Été 2021-22) Gaël De Oliveira-Sicard. Stage de recherche (Boursier BRPC, Projet), Auxiliaire de recherche. (LinkedIn)
  • (Été 2021) Jingxing Tu. Stage d’initiation à la recherche, (Projet) (LinkedIn)
  • (Été 2021) Frédéric Massi. Stage de recherche (Boursier BRPC, Sherbrooke/UQÀM). Cosupervision avec Maxime Descoteaux.
  • (Été 2020) Philippe Lemieux. Stage d’initiation à la recherche (Projet) (LinkedIn)